Kegiatan pengabdian masyarakat merupakan salah bentuk tri dharma perguruan tinggi, yang bertujuan untuk membantu masyarakat berdasarkan keahlian dan keilmuan yang dimiliki oleh civitas akademik program studi biologi UIN Sunan Ampel Surabaya. beberapa kegiatan pengabdian masyarakat ini tidak hanya dilakukan melalui kolaboratif dosen dan mahasiswa tetapi juga melibatkan masyarakat hingga stakeholder lainnya seperti:

    1. Pengmas Kolaboratif YAYASAN KEHATI dalam edukasi konservasi kelelawar sebagai bioindikator di kawasan gua Ngerong,Tuban tahun 2018
    2. Pengmas Kolaboratif YAYASAN KEHATI 2016 dalam kegiatan Pelatihan tepung biji nangka (artocarpus) di Desa Dadaprejo, Malang Jawa Timur tahun 2016

Selain itu terdapat pula kegiatan edukasi dan pelatihan yang bertujuan meningkatkan kemandirian masyarakat, seperti

    1. Edukasi pada siaran Radio RRI pro2
    2. Pelatihan Budidaya Cacing Tanah